Finalmente,
após dois dias a debater-me com problemas, após fazer um “fresh install” do Fedora Core 3, consegui correr os sites com php e com o mysql.
Aparentemente o php não conseguia “comunicar” com o mysql. Após algum googling, conclui que talvez de devesse ao facto do SeLinux estar instalado.
Ok…
Ao tentar desactivar o mesmo, o interface devolvia um erro, por causa de um bug dum upgrade a um rpm… Arghhhh…. Aplicando o patch no file, desactivando o Selinux, e tudo allright.
Já temos site again.